Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rtl8cQ9D6I0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.9 ms