Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm5Q9D6G9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm5Q9D6G9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms