Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms