Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zcchc13Q9D548 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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