Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7Q9D541 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7Q9D541 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms