Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9D4W2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms