Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gcc1Q9D4H2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms