Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tubgcp4Q9D4F8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms