Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms