Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UvssaQ9D479 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UvssaQ9D479 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms