Protein–RNA interactions for Protein: Q9D404

Oxsm, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OxsmQ9D404 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OxsmQ9D404 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OxsmQ9D404 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OxsmQ9D404 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms