Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gpn3Q9D3W4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms