Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph14Q9D3W1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms