Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pus10Q9D3U0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms