Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rufy3Q9D394 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms