Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pramef12Q9D2F1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms