Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nol3Q9D1X0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms