Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd3Q9D176 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms