Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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Hddc3Q9D114 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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Hddc3Q9D114 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Hddc3Q9D114 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Hddc3Q9D114 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Hddc3Q9D114 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Hddc3Q9D114 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Hddc3Q9D114 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hddc3Q9D114 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms