Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms