Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkain1Q9D035 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkain1Q9D035 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms