Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
2610524H06RikQ9CZU9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms