Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms