Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis18aQ9CZJ6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis18aQ9CZJ6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms