Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp2Q9CYZ8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssbp2Q9CYZ8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms