Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2fQ9CY34 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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