Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Exo5Q9CXP9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Exo5Q9CXP9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Exo5Q9CXP9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Exo5Q9CXP9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Exo5Q9CXP9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo5Q9CXP9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms