Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prdm5Q9CXE0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prdm5Q9CXE0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prdm5Q9CXE0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prdm5Q9CXE0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Prdm5Q9CXE0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Prdm5Q9CXE0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prdm5Q9CXE0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Prdm5Q9CXE0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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