Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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