Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pin4Q9CWW6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pin4Q9CWW6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms