Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms