Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Khdc3Q9CWU5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Khdc3Q9CWU5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Khdc3Q9CWU5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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