Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms