Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddx28Q9CWT6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ddx28Q9CWT6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ddx28Q9CWT6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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