Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ly6kQ9CWP4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms