Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms