Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dis3Q9CSH3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms