Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CR55 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CR55 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q9CR55 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9CR55 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9CR55 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9CR55 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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