Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ankrd1Q9CR42 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms