Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
4931417E11RikQ9CR05 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms