Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg12Q9CQY1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg12Q9CQY1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms