Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PompQ9CQT5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms