Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mri1Q9CQT1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mri1Q9CQT1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms