Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9CQM1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CQM1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CQM1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms