Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nudt21Q9CQF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt21Q9CQF3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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