Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap3bQ9CQE1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms