Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf138Q9CQE0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf138Q9CQE0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms