Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9CQC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9CQC3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms