Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med4Q9CQA5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med4Q9CQA5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms