Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ubl4bQ9CQ84 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms